器官移植科是国家肾脏移植质控中心的挂靠单位。主要从事肝脏、肾脏移植和肝胆外科的临床及基础研究工作。累计完成肝脏移植2600余例，肾脏移植2100余例，肝、肾移植技术达国际先进水平，先后开展了肝肾联合移植、胰肾联合移植、亲属肝移植、亲属肾移植、劈离式肝移植等复杂移植手术。成功创立了多个首例肝移植技术，如全国首例小儿多米诺肝移植、门-腔房转流肝移植、血型不合亲体肝移植等。

肝胆外科常规开展胰十二指肠切除、肝门部胆管癌根治、扩大半肝切除、胆囊癌根治等复杂肝胆胰手术，在不可切除中晚期肝胆胰恶性肿瘤的化疗、靶向、免疫等综合治疗和转化手术治疗方面处于国内领先水平，荣获国家科技进步奖二等奖1项，省、部级科技奖项9项。